以下のような PHP で SWF を編集すると、

$swf = new SWFEditor()
$swf->input($swfdata);
$vars = array('input_value' => 'this is pen.');
$swf->setActionVariables($vars);
echo $swf->output();

以下の ActionScript のように変数を受け取る事ができます。

internal_value = input_value

repacePNGData で透明度付きパレット形式画像を扱った際に、 意図しない場所が透明になる事のある不具合を修正しました。
PNG の tRNS チャンクから透明度情報を抽出する際に、 ひとつ大目に勘違いしていて、透明度付きパレット＋１ に対応するパレットの色が透明になる不具合がありました。
ごめんなさい。。

jpeg_segment_delete_node(jpeg_segment_t *jpeg_seg, int marker) {
    jpeg_segment_node_t *node;
    int count = 0;
    for (node=jpeg_seg->head ; node ; node=node->next) {
        if (node->marker == marker) {
            node->marker = -1; // remove mark;
            if (node->data_ref) {
                free(node->data_ref); // ☆☆コレ☆☆
                node->data_ref = NULL;
            }
            node->data_len = 0;
            count ++;
        }
    }
    return count;
}

わざわざ free されないように data_ref (他変数の参照だよ) という 分かりやすい変数名にしてたのに。。。シネバイイノニ。　＞ 自分

Program received signal SIGSEGV, Segmentation fault.
0x00c3473c in memcpy () from /lib/i686/nosegneg/libc.so.6
(gdb) bt
#0  0x00c3473c in memcpy () from /lib/i686/nosegneg/libc.so.6
#1  0x03b51cb0 in __glEmptyImage () from /usr/lib/libGL.so.1

コピー領域が確保できてない系の落ち方です。

#define php_array_to_long_array(z) (long *)php_array_to_c_array(z,TO_C_LONG,sizeof(long),NULL)

(関係ない所たくさん削ってみた)

void *php_array_to_c_array(zval *param,int type,int size,int *array_size)
{
    HashTable *param_ht = param->value.ht;
    tmp_size = zend_hash_num_elements(param_ht);
    zend_hash_internal_pointer_reset(param_ht);
    params = (void *)emalloc(size * tmp_size);
    while(zend_hash_get_current_data(param_ht,(void **)&cur) == SUCCESS) {
         convert_to_long(*cur);
         ((long*)params)[i] = Z_LVAL_P(*cur);
         zend_hash_move_forward(param_ht);
         i++;
    }
    return (void *)params;
}

文字通り、PHP の配列を C の配列にマッピングする関数です。
しかも、(上で引用したコードでは省略されてるけど) 入れ子な配列もきちんと、構造体への参照にしてくれる優れもの。

そもそも、呼ぶ前に必要な分(width x height)の array を確保しない時点で 落ちるのは、PHP の API として不味いので、そこから見直すべきですが、
width x height 分の array を渡しても落ちたので、多分そもそも動かない。
LONG(4byte)分のメモリ領域を確保してくれてるはずなので、パッと見は大丈夫そうなのですが。
なんだろう。

$pixels = array($width * $height);

$pixels = array_fill(0, $width * $height, 0);

PHP_FUNCTION(glreadpixels)
{
        ＜略＞
    v_pixels = php_array_to_long_array(pixels);
    glReadPixels((int)Z_LVAL_P(x),(int)Z_LVAL_P(y),(int)Z_LVAL_P(width),(int)Z_LVAL_P(height),(int)Z_LVAL_P(format),(int)Z_LVAL_P(type),v_pixels);
}

なので、何も値が返ってきません。

まず、引数を参照渡しにします。

ZEND_BEGIN_ARG_INFO_EX(force_ref_seventh_arg, 1, 0, 7)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg1)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg2)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg3)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg4)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg5)
    ZEND_ARG_INFO(0, arg6)
    ZEND_ARG_INFO(1, arg7)
ZEND_END_ARG_INFO()
function_entry opengl_functions[] = {
    <略>
    PHP_FE(glreadpixels,force_ref_seventh_arg)

PHP_FUNCTION(glreadpixels) の 最後に、

        long_array_to_php_array(v_pixels, (int)Z_LVAL_P(width) * Z_LVAL_P(height)* 4 /*U_LONG size*/, pixels);
}

の一行を追加してみたけど、何も変わる様子無いです。
long_array_to_php_array の処理は予想通りだったので、 Zend API の使い方に何か問題があるのかも。

そもそもこういう配列の使い方すると、メモリがすぐ溢れるので、 PHP の array で値を受け取るのは実用的じゃないよね。
結局のところ、PHP カンファレンスで使った glReadPixels_yoya が現実的な気がします。

v_pixels_len = (int)Z_LVAL_P(width) * Z_LVAL_P(height)* sizeof(long);
v_pixels = emalloc(v_pixels_len);
glReadPixels((int)Z_LVAL_P(x),(int)Z_LVAL_P(y),(int)Z_LVAL_P(width),(int)Z_LVAL_P(height),(int)Z_LVAL_P(format),(int)Z_LVAL_P(type),v_pixels);
long_array_to_php_array(v_pixels, v_pixels_len, pixels);

$pixels = array(); // 空配列を渡す
glReadPixels(0, 0, $width, $height, GL_RGBA, GL_UNSIGNED_BYTE, $pixels);

// GD でキャンバスを作る
$im = imagecreatetruecolor($width, $height);
$i = 0;
// pixels 配列を R, G, B, A(無視) の順で解釈してイメージを作成
for ($y = $height ; $y >= 0; $y--) {
    for ($x = 0; $x < $width ; $x++) {
        $rgb = $pixels[$i];
        if ($rgb < 0) {
            $rgb += 4294967296; // integer => float
        }
        $blue  = $rgb % 0x100 ; $rgb /= 0x100;
        $green = $rgb % 0x100 ; $rgb /= 0x100;
        $red   = $rgb % 0x100 ; $rgb /= 0x100;
        $color = imagecolorallocate($im, $red, $green, $blue);
        imagesetpixel($im, $x, $y, $color); // pixel を埋めていく
        $i ++;
    }
}
imagepng($im, "output.png"); // PNG ファイルとして保存!!!

PHP で無理やりバイト処理は心臓に悪いので、

array(array('red'=>..., 'green'=>..., 'blue'=>..., 'alpha'=>...))

の形式で返した方が良いと思いました。
メモリ使いすぎる問題は、それ以前に(パフォーマンス的に) PHP で こんなループ処理する事自体間違えてるので、extension の C 側の ルーチンで全部処理するのが正しいですね。
yglImagePNG($filename); みたいにバッファ吸出し＆画像出力を C 言語側で閉じて処理する新規 function を作ってみよう。